五华区疾病预防控制中心于2001年12月在原五华区卫生防疫站的基础上组建而成，工作用房面积3050㎡，位于昆明市篆塘路15号。2009年2月27日五华区健康教育所并入五华区疾病预防控制中心。承担辖区内突发公共卫生事件应急处置、传染病疫情控制、地方病及慢性病防治、计划免疫、卫生检验、结核病防治、性病艾滋病防治、健康教育、五大卫生监测、基本公共卫生服务项目指导等工作职责，承办区卫生和计划生育局交办的其他卫生防病工作，是实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的政府公益性事业单位。
2019年12月，软捷科技与五华区疾病预防控制中心签约艾滋病风险自测问卷调查系统项目，包括问卷调查管理、推荐检测地维护、系统管理等功能。系统支持微信端、移动端、PC端等多端访问，民众可以通过该系统参与各类艾滋病相关的风险评测服务。
